Představenstvo je řídícím, výkonným a statutárním orgánem JHK. Řídí činnost komory a rozhoduje o všech záležitostech, pokud nejsou zákonem, statutem, jednacím řádem či usnesením shromáždění delegátů JHK vyhrazeny jinému orgánu. Představenstvo odpovídá za svou činnost shromáždění delegátů JHK.

Představenstvo má 15 členů včetně předsedy a tří místopředsedů. Struktura představenstva respektuje územní členění JHK tak, že všechny oblasti mají jednoho zástupce v představenstvu JHK, sdružení pak po jednom zástupci v představenstvu JHK.

Představenstvo JHK zejména:

• připravuje podklady pro jednání shromáždění delegátů JHK a zajišťuje výkon jeho usnesení,
• odpovídá za hospodaření
• rozhoduje o pozastaveném rozhodnutí předsedy a místopředsedy,
• jmenuje a odvolává ředitele úřadu JHK,
• rozhoduje o přijetí za člena komory a o jeho vyloučení po předchozím projednání v radě oblastní hospodářské komory a radě sdružení
• řídí činnost komory prostřednictvím předsedy představenstva JHK a ředitele úřadu,
• schvaluje organizaci úřadu JHK a rozhoduje o zřízení a zrušení oblastní kanceláře JHK
• vytváří dle potřeby poradní orgány, jmenuje a odvolává jejich členy. 

Seznam členů představenstva Jihočeské hospodářské komory