Každý člen Jihočeské hospodářské komory si může dle svého zájmu a oboru podnikání zvolit, zda chce být zároveň členem některého z níže uvedeného oborového sdružení. Jednotlivá sdružení vyvíjí samostatně různorodé aktivity a sleduje novinky v daném oboru.

 Formální oborová sdružení JHK

Sdružení Stavebnictví a územní rozvoj Toto sdružení se zaměřuje na podporu podnikatelských aktivit a zajišťování potřeb svých členů v oblasti zprostředkování informací o možnostech výstavby a směru územního rozvoje v daném regionu.
Sdružení Doprava Sdružení doprava se zabývá problematikou dopravní infrastruktury. Aktivně spolupracuje se zástupci státní správy a místní samosprávy při řešení koncepce řešení dopravní situace v regionu.
Sdružení Reality Sdružení reality bylo vytvořeno k podpoře a ochraně profesních zájmů a vytvoření standardizace výkonu realitní činnosti. Pravidelně pořádá semináře, které reagují na aktuální dění v oboru.
Sdružení Cestovní ruch Cílem sdružení je podporovat rozvoj cestovního ruchu, zkvalitňovat služby a hájit zájmy svých členů a ostatních podnikatelů a subjektů v cestovním ruchu v regionu Jihočeského kraje.
Sdružení Elektrotechnika Hlavním cílem sdružení je obhajovat zájmy a působit na zvyšování odborné a právní úrovně svých členů. Svou činností pozitivně ovlivňovat podnikání v elektrotechnickém oboru a zvyšovat informovanost uživatelských podniků i laické veřejnosti.

Neformální oborová sdružení JHK

Neformální sdružení IT Klub IT Klub sleduje novinky v oblasti informačních technologií, konsultuje možná bezpečnostní rizika v oblasti zabezpečení výpočetní techniky a pravidelně pořádá semináře a školení v oblasti IT.
Neformální sdružení Klub personalistů Cílem Klubu personalistů je setkávání a navazování bližší spolupráce mezi podnikatelskou sférou, personalisty a systémy vzdělávání a řešení problému nedostatku kvalifikovaných zaměstnanců, který trápí řadu jihočeských firem.